Java está em / usr / bin no meu sistema OSX 10.9.4:
$ which java
/usr/bin/java
Esse diretório também está em seu caminho de comando.
A entrada em / usr / bin é um link simbólico. Talvez você esteja esperando que o diretório atual de instalação do java esteja em seu caminho, mas isso não precisa ser o caso. Criar links simbólicos em / usr / bin é uma prática comum.
$ ls -l /usr/bin/java
lrwxr-xr-x 1 root wheel 74 May 17 17:02 /usr/bin/java ->
/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/Current/Commands/java