Tente executar estes comandos no seu sistema para instalar o ffmpeg
cd ~/ffmpeg_sources
wget http://ffmpeg.org/releases/ffmpeg-snapshot.tar.bz2
tar xjvf ffmpeg-snapshot.tar.bz2
cd ffmpeg
PATH="$PATH:$HOME/bin" PKG_CONFIG_PATH="$HOME/ffmpeg_build/lib/pkgconfig" ./configure \
--prefix="$HOME/ffmpeg_build" \
--extra-cflags="-I$HOME/ffmpeg_build/include" \
--extra-ldflags="-L$HOME/ffmpeg_build/lib" \
--bindir="$HOME/bin" \
--extra-libs="-ldl" \
--enable-gpl \
--enable-libass \
--enable-libfdk-aac \
--enable-libfreetype \
--enable-libmp3lame \
--enable-libopus \
--enable-libtheora \
--enable-libvorbis \
--enable-libvpx \
--enable-libx264 \
--enable-nonfree \
--enable-x11grab
PATH="$PATH:$HOME/bin" make
make install
make distclean
hash -r
para mais detalhes, consulte este guia de instalação