Olhando a documentação para a variável global-linum-mode tem a resposta para o seu problema:
Setting this variable directly does not take effect; either customize it (see the info node
Easy Customization') or call the functionglobal-linum-mode'.
Portanto, a avaliação de (setq global-linum-mode t) não não fará com que linum-mode seja ativado para todos os buffers. Você avaliaria (global-linum-mode) para fazer isso.
Você está correto em seu comentário acima para ativar linum-mode apenas para determinados modos que você avaliaria (add-hook 'clojure-mode-hook linum-mode) (usando clojure-mode , por exemplo).