Todo protocolo tem sobrecarga. A cópia "LAN" sobre a qual você está falando é provavelmente o SMB / CIFS. O CIFS é bastante propenso a ser mal configurado (e, portanto, lento) e, em geral, tem mais sobrecarga do que o FTP.
FTP é um protocolo muito simplista. É difícil errar. CIFS é um protocolo complexo, muito provavelmente a implementação no telefone está limitada ou ligeiramente errada. Não é ruim o suficiente para causar uma falha ou qualquer coisa, mas apenas mais devagar
Com base nos comentários:
A diferença de velocidade que você está vendo entre o wireless e o USB é esperada. O USB 2.0 tem uma velocidade máxima de 480Mbit / s ou 60Mbyte / s. Em comparação, a velocidade máxima do G sem fio é de 54 Mbit / s, e até o N sem fio é de 144 Mbit / s ou 300 Mbit / s, dependendo da configuração. A maioria dos chipsets sem fio de telefone tem um limite de velocidade embutido devido a medidas de economia de custos (em energia ou preço). Por exemplo, não consigo ultrapassar 20Mbit / s com meu telefone, o que implementa a tecnologia sem fio G.
Além disso, mais uma coisa a ter em mente é que, geralmente, quando você usa um cabo USB para transferir arquivos, ele pode exigir muitos atalhos. Tudo o que tem a fazer é expor o cartão SD em um nível de bloco, não analisar sistemas de arquivos ou se preocupar com protocolos. A diferença de velocidade devido a isso é provavelmente insignificante, mas tenho certeza que é mensurável.