Sim, você pode. Se você colocar a unidade Linux na posição principal no cabo, talvez seja mais fácil.
Você realmente não deu informações suficientes; você deveria ter nos dito qual distribuição você está usando. Sua instalação do Linux provavelmente já possui um gerenciador de inicialização nesse disco. Se você instalou uma área de trabalho completa, o carregador de inicialização provavelmente é um dos seguintes: Grub, Grub2, LILO.
Eu vou adivinhar e assumir que você está usando o Ubuntu e vinculá-lo aqui. link
Se você fornecer informações, receberá ajuda melhor.
Na verdade, existe um link nessa página que provavelmente é mais adequado para você, mas você deve ler essa página para entender melhor. Esta página é sobre como reinstalar o carregador de boot depois de ter instalado o Windows. Realmente você estará informando um gerenciador de inicialização funcional sobre janelas como uma opção de partição inicializável. link