Sim, os clusters e o tamanho da unidade de alocação são normalmente os mesmos. Os arquivos são divididos em partes lógicas no disco com base no tamanho da alocação.
O 4KB é o padrão em alguns sistemas, mas achei que o Windows aumentaria automaticamente o tamanho do cluster, dependendo do tamanho da sua unidade.
Você pode aproveitar link para obter mais informações e diagnosticar o problema sozinho (ou seja, para detectar o tamanho da alocação do ACTUAL).
P.S. - USB 2.0 é um protocolo terrível para um disco rígido, então eu recomendo strongmente que você encontre qualquer outra alternativa possível e use isso. Especialmente com um disco tão grande ... 1 TB é muito.
Se você estiver fazendo um chkdsk "completo" para garantir que o sistema possa ler e escrever de maneira confiável em todos os setores, levará muitas horas, independentemente do link que estiver usando. Se houver um setor ruim no disco, não se preocupe (a menos que haja muitos ); o sistema de arquivos tratará automaticamente quando receber um erro de gravação.