Parece-me que você pode estar pensando em algumas coisas aqui. Se o seu BIOS já vir o (s) seu (s) disco (s) rígido (s), é óbvio que o BIOS não está piscando ou piscando novamente - portanto, pare de brincar com fogo. Sobre as únicas coisas que você pode querer verificar em seu BIOS "configurações" pode ser se o seu disco rígido não está sendo endereçado corretamente, como se o RAID está habilitado / desabilitado ou se você está tentando forçar o NCQ / TCQ em uma unidade que doesn apóie ou algo assim. Então, novamente, se você tiver unidades PATA, você pode ter simplesmente se esquecido de configurar / remover jumpers referentes às configurações de seleção mestre / escravo / cabo.
Mas, pessoalmente, parece-me que você provavelmente tem alguns problemas de inicialização do disco rígido em que seu registro mestre de inicialização possivelmente foi confuso. E não importa como você olhe, esse tipo de problema não é relacionado à BIOS.
Eu posso ter outras sugestões melhores. Mas se tudo isso parece muito complicado, então você tentou o gerenciador de boot do PLoP para fazer o que você tem feito o tempo todo? O PLoP é um gerenciador de cadeias muito simples que permite selecionar o dispositivo de inicialização e inicializar o sistema operacional. Você pode até mesmo executar o PLoP a partir de um disquete ou usá-lo para inicializar um pen drive em um ambiente virtual (supondo que você entenda seu cliente VM). É uma coisa muito útil de se ter, já que você pode usar o PLoP para forçar computadores mais antigos a inicializar de dispositivos mais modernos dos quais nunca foram projetados para inicializar - como dispositivos USB ou até mesmo outros discos rígidos. O PLoP ainda não permitirá a inicialização pela rede, que é apenas um déficit, mas eu ainda acho que o PLoP pode valer a pena considerar, especialmente quando você vê o quão pequeno é.
Para obter instruções sobre como fazer com que seu disco de inicialização do PLoP veja a seção 7 nesse link. Para instalar o PLoP em um disco rígido, consulte a seção 6 (embora eu não recomende).
Boa sorte.