Sim, desde que o software do seu servidor de FTP suporte (99,9%).
Geralmente, você deve conseguir configurar o acesso específico a pastas na seção "gerenciamento de usuários".
Lembre-se de que, se você negar o acesso à raiz do servidor, o usuário não poderá acessar as subpastas.
Ou seja: CONFIGURAÇÃO CORRETA:
FTP_ROOT_FOLDER - > Conceder acesso a todos
---- > FTP_FOLDER_1 - > Conceder acesso ao usuário1
---- > FTP_FODLER_2 - > Conceder acesso ao usuário2
CONFIGURAÇÃO INCORRETA:
FTP_ROOT_FOLDER - > Sem acesso
---- > FTP_FOLDER_1 - > Conceder acesso ao usuário1
---- > FTP_FOLDER_2 - > Conceder acesso ao usuário2
CONFIGURAÇÃO INCORRETA:
FTP_ROOT_FOLDER - > Conceder acesso a todos
---- > FTP_FOLDER_1 - > Negar acesso ao usuário1
--------- > SUB_FOLDER_1 - > Conceder acesso ao usuário1