Acho que seu computador está usando uma grande quantidade de memória / processamento gráfico, pesado o suficiente para reduzir os recursos disponíveis para o Aero.
Em tal situação, o Windows desliga o Aero automaticamente.
Verifique se algum processo está levando memória excepcionalmente alta do que a exigida no Gerenciador de Tarefas. Identifique o aplicativo para esse processo, tente desativar esse aplicativo e veja se o problema persiste.