Na verdade, isso é principalmente para resolver o problema de resfriamento. A idéia geral é que você tem mais espaço aberto ao redor da parte inferior do gabinete, deixando a fonte de alimentação mais (e mais fria) ar para puxar de dentro do gabinete. Além disso, na parte inferior do gabinete, ele não lutará tanto com o processador por ar frio.
Alguns casos também permitem que a fonte de alimentação seja instalada na parte superior ou inferior (ou em ambas) para atender às suas necessidades (por exemplo, um equipamento de ponta com várias placas de vídeo pode usar duas fontes de alimentação).