defaults write com.apple.dock workspaces-auto-swoosh -bool NO && killall Dock
Embora isso desabilite a troca de janelas a qualquer momento, o aplicativo é ativado (CMD + TAB ou clique no ícone do aplicativo no Dock). Se você quiser desabilitar isso apenas quando abrir, não tenho certeza da melhor maneira de fazê-lo.
Uma maneira seria ter um script de login que executa o comando acima, inicia todos os seus aplicativos para você em seus respectivos espaços e, em seguida, define o comportamento para o estado alternativo (-bool YES).