Estou usando o Win7, mas o texto deve ser o mesmo:
- No Gerenciamento de dispositivos, vá em Visualizar > Mostrar dispositivos ocultos (verifique se está marcado).
- Isso mostrará uma categoria de dispositivo chamada "Drivers que não são plug and play".
- Localize o driver "Beep" e desative-o.
O sinal sonoro deve poder ser desativado com segurança. Você pode ter que reiniciar para que ele tenha efeito.