Pelo que pude encontrar no google, ele não usa a transparência alfa do PNG por padrão, mas há um truque para ativá-lo.
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(copiar e colar: no mapa, arraste o mapa difuso até a opacidade e certifique-se de copiá-lo. Em seguida, no material de opacidade, altere a saída mono para alfa. Além disso, certifique-se do difuso e opacidade que o alfa pré-multiplicado não está marcado, isso pode atrapalhar algumas vezes)