Tente conectar o ventilador a outro conector para ter certeza, mas parece que você está morrendo de raiva. Faz algum ruído estranho quando funciona? Se este é o ventilador do processador, eu certifique-se de substituí-lo e verifique se ele está funcionando corretamente.
Certifique-se de que todos os conectores de energia também estejam seguros e verifique se tudo está limpo.
Se o computador parar de funcionar e o ventilador ao mesmo tempo, também há uma chance de você estar com problemas aleatórios de fornecimento de energia. Eu começaria a me certificar de que o ventilador funcionaria primeiro. Comece com peças fáceis e baratas e, em seguida, suba.
Em alguns sistemas, há o principal conector de energia de 20/24 pinos e um conector de energia adicional de 4 ou 8 pinos. Certifique-se de que tudo esteja conectado de forma segura. Tenho a sensação de que você está tendo problemas de fornecimento de energia se ele funciona aleatoriamente bem e, em seguida, nada.