Eu tive essa configuração. Funcionou muito bem.
Para cada máquina, eu tinha o centro, o monitor compartilhado era o monitor secundário. Os monitores externos eram o monitor principal de cada sistema, mantendo a barra de tarefas e os menus.
Eu não usei o Synergy. Em vez disso, usei o teclado e o mouse conectados ao switch kvm. Cada máquina também tinha um mouse adicional conectado, para que eu pudesse afetar a máquina quando o interruptor kvm estivesse apontado para a outra máquina.