É provavelmente por causa da segurança.
Quando o flash está focado, o navegador não tem ideia de qual tecla foi pressionada.
O Flash sabe disso, mas não é confiável pelo navegador. Se o navegador confiasse no Flash o que foi pressionado, em um minuto você teria um monte de scripts flash maliciosos que falsificariam as informações de pressionamento de tecla e tornariam o seu navegador louco.
Desta forma, uma possível falha de segurança é evitada, embora às custas do conforto do usuário.