Para qualquer arquivo que exija a execução de um manipulador ou tempo de execução, execute o manipulador ou aplicativo de tempo de execução como /high
e, em seguida, use o método apropriado para esse aplicativo para chamar o arquivo que deseja executar.
Como observa EBGreen, para arquivos msi, você executa msiexec com alta prioridade e, em seguida, transmite o argumento e o caminho do instalador.
start /high "msiexec /i installer.msi"