Você pode remapear todo o teclado se quiser, emacs recentes até têm um menu e GUI para ajudá-lo com isso.
O problema é que o C-C, em particular, é um prefixo para muitos outros comandos. Tudo isso acabaria precisando ser anexado a novas combinações de teclas. Embora seus hábitos de recortar e colar possam ser difíceis, a longo prazo, você pode ter mais alegria se "enviar" para as convenções do Emacs, em vez de tentar forçá-los a seguir as teclas do Windows.