Na linha de comando, primeiro instale o pacote texlive, se ainda não estiver instalado:
sudo apt-get install texlive
Em seguida, use o utilitário pdflatex para converter o arquivo da seguinte forma:
pdftex /path/to/myfile.tex
O caminho /path/to/myfile.tex é, obviamente, um caminho de exemplo. Você colocaria o caminho para o seu próprio arquivo no seu sistema.
Observe que, embora o utilitário seja chamado pdflatex, você o executa com o comando pdftex (sem o la ).
Existem várias configurações sobre as quais você pode ler na ajuda do pdflatex:
pdflatex --help
A configuração que mais uso é a que gera o pdf em um diretório diferente:
pdflatex /path/to/myfile.tex --output-directory=../otherdir
O utilitário pdflatex também é interativo, de modo que, se você esquecer de fornecer as informações necessárias, ele será solicitado a inseri-lo antes de converter o arquivo.