Primeiro eu gostaria de aconselhá-lo a checar os locais das chaves de execução no registro para qualquer sistema operacional mais antigo que o vista, já que faz muito tempo desde que eu trabalhei neles, então pode haver diferenças que eu não faço. Lembre-se.
Se eu estou entendendo sua pergunta corretamente, este script em lote deve fazer o que você quer. Ele te dá um menu simples para escolher adicionar ou remover um programa das teclas de execução (startup), e então deixa você colocar no programa nome e caminho para o executável.
:begin
cls
@echo off
echo Program startup Utility
echo.
echo 1. Add Program to Startup
echo 2. Remove Program From Startup
echo x. Exit
set /p choice= Choose A Service:
if not '%choice%'== set %choice%=choice:~0,1%
if '%choice%'=='1' goto :addstartup
if '%choice%'=='2' goto :delstartup
if '%choice%'=='x' goto :exit
:addstartup
cls
echo/
echo/
echo Add Program to Startup
echo or type back to go to main menu
echo/
set /p keyname= Please State Program Name:
if '%keyname%'=='back' goto :begin
set /p expath= Please Enter Path to Executible:
if '%expath%'=='back' goto :begin
reg add HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\ /v %keyname% /t REG_SZ /d "%expath%"
timeout /t 3 >nul
goto begin
:delstartup
cls
echo/
echo Remove Program From Startup
reg query HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\ /s
echo/
set /p keyname= Please Enter Program Name:
reg delete HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\ /v "%keyname%" /f
timeout /t 3 >nul
goto begin
Como alternativa, se você precisar apenas adicionar ou remover o mesmo programa e não precisar inserir vários nomes de programa ou caminhos exe, poderá modificar o script dessa forma e substituir% keyname% por seu programa. name, e% expath% com o caminho para o seu executável (sem os% 's) e, em seguida, salve-o. Certifique-se de que seu nome-chave seja o mesmo em adicionar e remover.
Você também pode trocar as linhas "goto begin" por "exit" se quiser apenas sair do script após a ação selecionada.
:begin
cls
@echo off
echo Program startup Utility
echo.
echo 1. Add Program to Startup
echo 2. Remove Program From Startup
echo x. Exit
set /p choice= Choose A Service:
if not '%choice%'== set %choice%=choice:~0,1%
if '%choice%'=='1' goto :addstartup
if '%choice%'=='2' goto :delstartup
if '%choice%'=='x' goto :exit
:addstartup
cls
reg add HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\ /v %keyname% /t REG_SZ /d "%expath%"
timeout /t 2 >nul
goto begin
:delstartup
cls
reg delete HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\ /v "%keyname%" /f
timeout /t 2 >nul
goto begin