O ventilador não deve parar de girar. A única coisa que deve mudar é a dos fãs da RPM. A mudança no RPM não é fácil de perceber a olho nu, mas você pode, algumas vezes, ouvi-lo aumentar de velocidade. Se o ventilador parar de girar, ele irá parar de resfriar o dissipador de calor que afasta o calor da CPU. Portanto, a CPU eventualmente fica muito quente e é desligada automaticamente para tentar evitar danos.
Você pode tentar substituir o dissipador de calor para ver se isso resolve o problema.