Você já tentou remover o ClipMenu? Parece que o projeto não foi atualizado para apoiar o Yosemite: link
Além disso, você pode ver qual grupo de aplicativos está usando a área de transferência do Mac com o Finder - > Editar - > Mostrar área de transferência.
Solução final:
launchctl list | grep com.apple.pboard
para verificar a existência do daemon do pboard (Isso deve ser cuspido). Então:
launchctl stop com.apple.pboard
launchctl start com.apple.pboard
Em seguida, mate um aplicativo na lista de defeitos, reinicie-o e veja se ele começa a funcionar na boa lista.