Ok o "problema" foi o módulo "reqtimeout" ativado. Se nada estiver configurado, o valor padrão é este:
RequestReadTimeout header=20-40,MinRate=500 body=20,MinRate=500
o que significa que os cabeçalhos devem ser iniciados em 20 segundos
eu adicionei uma linha de configuração ao nosso vhost
RequestReadTimeout header=300-360,MinRate=500 body=300-360,MinRate=500