Uma maneira é usar uma ferramenta como o ImageMagick. Que está disponível gratuitamente.
You can read more than one image from a sequence with a frame range. For example, you can extract the first four frames of an image sequence:
$ convert 'images.gif[0-3]' images.mng
Se você tiver quadros em arquivo separado, tenho certeza que você pode usar um comando como
$ convert image_1.jpg image_2.jpg image_3.jpg images.mng
ou
$ convert -append image_*.jpg images.mng
mas note que não tentei isso. Não tenho certeza se você precisa da opção -append
.