Verifique se as adições dos convidados na caixa estão atualizadas (o vagrant-vbguest plugin pode ajudar ). Especialmente se você estiver executando o aplicativo de uma pasta sincronizada.
E se você realmente usar a pasta sincronizada, usar o NFS pode dar bastante aceleração (consulte este blog ). O Vagrant 1.5 oferecerá uma pasta sincronizada com o rsync, mas até lá você também pode copiar o código do aplicativo para o disco nativo da VM se o desempenho ainda for um problema.