Versão 2.6
Shift + Clique em no globo ocular, na camada que deseja manter visível.
Versão 2.8
Instalado a partir do link
sudo add-apt-repository ppa:otto-kesselgulasch/gimp
sudo apt-get update
sudo apt-get install gimp
O Gimp 2.8 ainda irá alternar as camadas visíveis usando Shift + Clique no globo ocular, mas agora com camadas dentro dos Grupos de camadas o Gimp respeitará as camadas que são invisíveis ou visíveis dentro de um grupo, há uma discussão aqui por desenvolvedores - 1
O que isto significa é que quando você torna uma camada invisível dentro de um grupo, ela permanecerá invisível ao alternar a visibilidade de outras camadas e grupos.
Antes de alternar e depois de alternar, estou alterando a visibilidade da camada apontada pela seta vermelha.
----------------
Observe que a camada dentro do grupo de camadas permanece invisível ao alternar as outras camadas com Shift + Clique em
Agora, para as más notícias, isso também significa que Ao tentar alternar a visibilidade de muitas camadas Dentro de uma camada Grupo Não funciona, apenas selecionando a visibilidade do grupo como um Todo,
Observe que estou alterando a visibilidade da camada apontada pela seta vermelha, mas apenas as camadas externas ao grupo são afetadas.
Ainda não encontrei nenhuma solução alternativa para esse comportamento.