AFAIK, não há solução perfeita para esse tipo de tarefa. A melhor prática depende do conteúdo da sua planilha - especialmente se você quiser manter as fórmulas também.
Geralmente, você pode soltar as regras relacionadas à formatação condicional, salvando a planilha como HTML e carregando novamente o HTML no Calc. Naturalmente, isso também deixará coisas como funções - apenas mantendo os resultados do cálculo. Ele também soltará folhas de estilo.
Se você deseja manter, por exemplo, funções, pode continuar conforme descrito, mas mantenha o arquivo original. Agora, copie o HTML importado e cole apenas os formatos, mantendo o conteúdo da célula original. O resultado deve ser uma folha do Calc com conteúdo de célula original e formatação não condicional. Talvez exagerar de novo, mas isso depende das suas necessidades ...