O cartão é tão simples que realmente não importará em qual slot você o conectou.
Vá com o PCI Express 3.0 com 8 pistas, pois ele tem a mesma largura de banda total que o pcie 2.0 com 16 pistas. Mesmo se a placa de vídeo for pcie 2.0, a diferença de desempenho com o hd7750 fará pouca ou nenhuma diferença.
Se você usar o x16 com 4 faixas, provavelmente notará isso.
A hora em que x8 ou x16 realmente importam é quando você tem uma placa de vídeo topo de linha. Até que você tenha uma Radeon 7970 ou 7990 ou a nvidia 680.690, ou titian, você não notará diferença significativa.
Revisei os benchmarks aqui: link