Sobre transparência, por favor, experimente este tutorial .
Para resumir: você deve brincar com compiz . Execute sudo apt-get install compizconfig-settings-manager compiz-plugins em seu console para instalar os pacotes necessários (ele também instalará compiz , resolvendo dependências). Em seguida, execute o comando ccsm no seu terminal. Ele irá mostrar ferramenta gráfica com compiz preferences.You pode encontrar configurações de transparência (e muitos outros) lá.
Se você está procurando temas para o Unity, isso pode ser um lugar para começar. Qualquer coisa marcada como GTK 3.x deve funcionar com o Unity. Você deve colocar os arquivos baixados em /usr/share/themes e /usr/share/icons .