Eu também estava atingindo esse problema em 16.04, mas com contas de rede do AD via SSSD.
Depois de muitas tentativas e erros, usei o seguinte para me livrar da conta:
Listar todas as contas:
# qdbus --system org.freedesktop.Accounts
..
/org/freedesktop/Accounts/User1000
/org/freedesktop/Accounts/User10000
Agora, para remover o usuário com o UID 10000:
Opcionalmente (se for um usuário do AD): adduser deleteme e defina o UID como 10000 em / etc / passwd; caso contrário, o próximo passo falhará
Excluir usuário via dbus:
dbus-send --system --print-reply --type=method_call --dest='org.freedesktop.Accounts' /org/freedesktop/Accounts org.freedesktop.Accounts.DeleteUser int64:<ENTER UID HERE> boolean:false
Isto irá apagar tanto "deleteme" do passwd como se livrar da entrada no lightdm e no menu "user switcher" (canto superior direito quando logado)