No meu caso, havia duas entradas na tabela WORK_QUEUE no arquivo .svn / wc.db em minha cópia de trabalho (que se referia ao arquivo ausente no diretório temp como resultado da mesclagem com falha).
Eu usei o SQLite Expert Personal para abrir wc.db e excluir essas duas linhas de WORK_QUEUE.
Eu tive que tentar isso algumas vezes, provavelmente devido ao uso da extensão do shell do TortoiseSVN explorer, eu precisava reiniciar o explorer após excluir as linhas do wc.db e antes de tentar uma limpeza do SVN.
O SVN Cleanup foi bem-sucedido depois que as linhas inválidas foram excluídas e o explorador foi reiniciado.