Tudo bem, eu entendi qual é o problema.
Na primeira inicialização, tudo bem.
Então eu reiniciei, entrei no UEFI BIOS e habilitei o VT-d (o que é totalmente irrelevante para as opções do USB 3.0).
O USB 3.0 não funciona depois disso.
Solução: Entrou no UEFI BIOS, alterou a configuração de USB 3.0 de Auto
para Enabled
.
Eu juro que não mudei a configuração do USB 3.0 quando entrei pela primeira vez na BIOS!
Ainda não tenho idéia por que a opção padrão não funcionou ... até funcionou pela primeira vez. : P