Eu usei MoveOut (juntamente com algumas tarefas agendadas) para fazer isso no Windows. Esse artigo de Ghacks discute o MoveOut, e parece haver algumas alternativas para ele com hiperlinks no final. QuickMove também parece promissor, embora você pode ter que agendar isso. Eu sugeriria escrever um regex para corresponder aos nomes dos arquivos que você gostaria de mover.