Eu não tenho certeza sobre isso, mas talvez você precise alterar a propriedade da própria pasta do Dropbox. O comando que você está usando altera o proprietário de cada arquivo / pasta dentro de / media / data / Tomas / Dropbox, mas não chama explicitamente a própria pasta.
Tente passar o caminho da pasta raiz do Dropbox para chown assim:
sudo chown -R thomas:thomas /media/data/Tomas/Dropbox
Se o Dropbox estiver rodando como usuário 'tomas', você também deve executar o comando chmod -R
nesta pasta que dá ao 'tomas' todas as permissões para a árvore de diretórios. O AFAIK Dropbox não pode alterar as permissões em si.
Na verdade, a propriedade deve ser irrelevante, desde que o usuário que está executando o Dropbox receba permissões de leitura / gravação em toda a árvore de diretórios do Dropbox, portanto o chmod pode ser o mais importante dos dois.