Parece que o SQL Server Management Studio suporta, de fato, o SQL Server Compacto No entanto, dependendo de onde você está realmente hospedando a instância, a melhor ferramenta pode ser algo diferente .
Se você está procurando uma ferramenta gráfica (para visualizar as tabelas, em vez de usar consultas T-SQL), eu encontrei esta lista de ferramentas do SQL Server Compact . O CEQuery parece particularmente promissor, e está no CodePlex, então é totalmente gratuito.