É verdade que você está usando uma versão desatualizada que teve problemas com isso. Conforme observado no changelog:
Changes between 0.9.2 and 0.9.3:
- Various crashes fixed > in PS, SSA, **mkv, xspf, freetype
Você também pode querer dar uma olhada no CCCP - Pacote de Codec Comunitário Combinado. Ele me ajudou a corrigir muitos problemas com Reprodução de m4v, especialmente com legendas.