Não faz sentido para mim, os dados já foram escritos - não criptografados - para C: \ como, como isso pode retroativamente alterar os dados existentes? Simplesmente faz uma cópia e apaga o original? Pensei nisso, mas isso não exigiria uma proporção igual ou maior de espaço livre: usado? Não haveria também o potencial de recuperação?
Isso só se aplica a novos arquivos recém-criados? Quase todos os programas de criptografia exigem que você crie uma nova partição / contêiner.
O Truecrypt aparentemente criptografa no local, o que, é claro, requer algum espaço livre. Como isso pode falhar, o processo começa com a criação de um CD de inicialização de recuperação.
Se você quiser ver como funciona, este vídeo é para você: Criptografando a partição de sistema do Windows com Truecrypt 5.0
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