O último chrome (10.x) tem algo chamado "Click to play", que permite ao chrome exibir um pequeno ícone onde normalmente o flash / java / silverlight estaria. O usuário precisa clicar na área para reproduzi-lo.
Você pode ativar esse recurso indo até 'about: flags' e ativá-lo. Depois disso, você pode escolher em "Opções" - > 'Under the Hood' - > 'Configurações de conteúdo' - > 'Plugins' o que fazer quando o Chrome encontra um plugin.