Meu USB está formatado como fat32. Se você usar o "Criador de disco de inicialização", não deverá ter nenhum problema com um dispositivo USB formatado com o formato fat32. Basta dar o ISO que você deseja copiar e ele fará o resto por você.
Depois de criar o meu 14.04LTS USB inicializável para instalação, o Utilitário de Disco mostra que o formato é W95 Fat32 Bootable. Feito automaticamente pelo criador de disco de inicialização, espero que isso ajude.