o motivo pelo qual você não pode arrastar janelas de uma 'cabeça' para outra 'cabeça' é (como CarlF comentou corretamente) que sua configuração está no modo "x display separado" e não no "xinerama mode" (também conhecido como "twinview in nvidia-land ou" bigdesktop ").
essa configuração de "exibição x separada" significa que cada cabeça pode executar uma configuração completamente diferente em termos de profundidade visual, tamanho, taxa de quadros, etc. assim, uma janela criada em uma cabeça (o termo é na verdade "tela") pode não se mova para a outra cabeça porque os "pixels não combinam".
checkout link e configure seu xserver corretamente, então seus problemas desaparecerão.