Pessoalmente, ainda acho que desfragmentar uma unidade a cada poucos meses ajuda a manter tudo em movimento rapidamente. Não é uma melhoria tão dramática como costumava ser, mas ainda parece ajudar.
Estou mais curioso para saber se as unidades SSD tornarão a desfragmentação desnecessária, já que a penalidade por leituras aleatórias é muito menor do que com os HDDs.