Às vezes, a fonte é codificada no aplicativo.
Nesse caso, você não tem chance de alterar sua fonte pelas configurações globais do Windows.
Lembre-se de quando a Microsoft decidiu amenizar um pouco a cor de fundo da caixa de diálogo? (Windows 2000 / ME) De repente, muitos aplicativos tinham diálogos com uma mistura de cores cinza escuras e claras. (Na maioria das vezes, quando os glifos / ícones não eram transparentes e, em vez disso, tinham o antigo fundo de cor do diálogo)