O seu VPS não tem memória suficiente disponível. Você pode ver quanto há executando:
'free -gh'
O g mostra quanta memória está disponível em gigabytes e h coloca em formato legível por humanos. Você usa mh se quiser ver em megabytes.
Para que yum funcione, você precisará interromper os serviços para liberar memória. Você pode ver quais processos estão usando a quantidade de memória usando o comando ps .