Você precisa dimensionar as imagens para um tamanho comum. Adicione um filtro de vídeo scale
:
ffmpeg -r 1/2 -i img%03d.jpg -i example.ogg \
-vf "scale=1920:1080,format=yuv420p" \
AL_SlideShow.mkv
Se você quiser usar libx265
, você precisa especificar -c:v libx265
também.
Você pode querer adicionar -shortest
antes do nome do arquivo de saída para parar a codificação quando todas as imagens tiverem sido lidas. Dessa forma, o fluxo de áudio será cortado.