A resposta é baseada no comentário do @Ynhockey:
Isso pode ser feito usando extensão do Keyconfig .
Depois que o Keyconfig não puder ser instalado com o Extension Manager padrão, siga estas instruções:
- Faça o download e salve o arquivo de extensão em seu disco rígido.
- No Mozilla Thunderbird, abra os complementos no menu Ferramentas.
- No botão de opções ao lado do campo de pesquisa de complementos, selecione "Instalar Complemento do Arquivo ..." e selecione o complemento baixado.
- Reinicie o Thunderbird e use o complemento instalado para desativar qualquer atalho de teclado desejado.