Existe uma solução que encontrei aqui , você não precisa reiniciar ou reiniciar o X, você pode consertá-lo sem perder o seu trabalho, mas o seu trabalho não pode mais ser visualizado na área de trabalho, eles continuarão rodando em segundo plano até que sejam finalizados ou mortos por você. Ainda é útil para os programas que precisam de mais tempo para serem executados.
A solução é pressionar Ctrl + Alt + F1 e chegar a um console linux raw, depois digitar o comando
pgrep compiz
para obter o PID do gerenciador de janelas afetado e, em seguida, eliminá-lo
pkill compiz
se não funcionar, tente
pkill -9 compiz
espere um pouco, se você repetir o pgrep, você deverá ver
1) sem resultado ou 2) PID diferente
Então você pode usar Ctrl + Alt + F7 e você encontrará o trabalho da área de trabalho novamente!