Eu tenho o mesmo problema. A única maneira de resolvê-lo é instalar o "boot-repair" no live CD e ir para opções avançadas e reinstalar o grub. Depois de ter reparado, NÃO vá perto do grub customizer novamente porque ele irá quebrá-lo novamente.
Aqui está um link que ajudará você a instalar o "reparo de inicialização" link