Bem, em um mundo perfeito, você provavelmente executaria e-mails através de ambos antes que os e-mails chegassem perto de uma máquina cliente ... Mas isso é uma discussão para outra ocasião.
Simplificando, o SpamAssassin é uma escolha mais segura. Pode não ser muito spam (provavelmente será), mas é menos provável que você obtenha falsos positivos. Isso para mim é uma parte muito importante do desempenho.
Mas ambos os sistemas precisam receber ordens para classificar o ham do spam. Você não pode realmente esperar apenas começar a usar algo assim e obter 100% de precisão. Puxar coisas como spamhaus para ajudar. Treine-o marcando os arquivos corretamente.
Se você puder poupar tempo para a configuração, use este gerador para definir rapidamente algumas regras básicas.