Parece que você deseja monitorar as alterações no sistema de arquivos.
A solução mais simples que posso imaginar seria executar o comando find em todo o sistema de arquivos e salvar sua saída em um arquivo de texto. Você pode fazer isso novamente em algum momento posterior.
Agora você pode executar um diff nos dois arquivos de texto e ver o que mudou no sistema de arquivos.
Para uma solução mais elegante, você pode dar uma olhada no tripwire que tem uma funcionalidade específica para monitorar alterações no sistema de arquivos.
Um tutorial para configurar o tripwire no ubunutu / debian está disponível em como usar o tripwire para detectar intrusões de servidores em um ubuntu vps
Uma regra de tripwire de exemplo para sua pasta mongo pode ser:
(
rulename = "User filesystem changes",
severity = $(SIG_HI)
)
{
/path/to/folder -> $(SEC_CONFIG) ;
}