Parece que não há emulação direta do config.sys no DosBox. Um dos desenvolvedores foi questionado sobre isso em SourceForge . Ele disse que "Você pode, no entanto, inicializar uma versão do dos dentro do DOSBox (usando o comando de inicialização) nessa versão, você pode colocar o que você gosta."
Eu examinei o Comando de inicialização e ele usa imagens de unidade do DOS, se você tiver alguma. Isso substitui os diretórios do DosBox, então pode não ser o que você está procurando.
No entanto, encontrei algumas informações interessantes aqui , sobre emulação de MSDOS no Windows XP. Eu não sabia disso antes, mas você pode configurar arquivos config.sys e autoexec.bat personalizados em um atalho para um prompt de comando. Ele ainda permite que você altere a emulação do timer do hardware, para que os programas antigos do DOS (jogos) não funcionem muito rapidamente:)
Espero que isso ajude!